res.null0 <- res.dat[res.dat$eff.size==0 & res.dat$dif.size==0,] points(y=res.null0$h0.rejected.p,x=rep(1,nrow(res.null0)),col='gray',pch=3) res.null3 <- res.dat[res.dat$eff.size==0 & res.dat$dif.size==0.3,] points(y=res.null3$h0.rejected.p,x=rep(2,nrow(res.null3)),col='#590b0c',pch=3) res.null5 <- res.dat[res.dat$eff.size==0 & res.dat$dif.size==0.5,] points(y=res.null5$h0.rejected.p,x=rep(3,nrow(res.null5)),col='#053305',pch=3) ## Proportion of rejected h0 per dif value in h0 scenarios (A) by DIF size (1 item) par(mfrow=c(2,2)) # 0 item res.null <- res.dat[res.dat$eff.size==0 & res.dat$nb.dif==0,] boxplot(h0.rejected.p~dif.size,data=res.null,col=c(2),xlab='DIF size', ylab='H0 rejection proportion in target scenario',main='No DIF',ylim=c(0,1)) points(y=res.null$h0.rejected.p,x=rep(1,nrow(res.null)),col='#590b0c',pch=3) # 1 item res.null <- res.dat[res.dat$eff.size==0 & res.dat$nb.dif==1,] boxplot(h0.rejected.p~dif.size,data=res.null,col=c(2,3),xlab='DIF size', ylab='H0 rejection proportion in target scenario',main='DIF on 1 item',ylim=c(0,1)) res.null3 <- res.null[res.null$dif.size==0.3,] points(y=res.null3$h0.rejected.p,x=rep(1,nrow(res.null3)),col='#590b0c',pch=3) res.null5 <- res.null[res.null$dif.size==0.5,] points(y=res.null5$h0.rejected.p,x=rep(2,nrow(res.null5)),col='#053305',pch=3) # 2 items res.null <- res.dat[res.dat$eff.size==0 & res.dat$nb.dif==2,] boxplot(h0.rejected.p~dif.size,data=res.null,col=c(2,3),xlab='DIF size', ylab='H0 rejection proportion in target scenario',main='DIF on 2 items',ylim=c(0,1)) res.null3 <- res.null[res.null$dif.size==0.3,] points(y=res.null3$h0.rejected.p,x=rep(1,nrow(res.null3)),col='#590b0c',pch=3) res.null5 <- res.null[res.null$dif.size==0.5,] points(y=res.null5$h0.rejected.p,x=rep(2,nrow(res.null5)),col='#053305',pch=3) # 3 items res.null <- res.dat[res.dat$eff.size==0 & res.dat$nb.dif==3,] boxplot(h0.rejected.p~dif.size,data=res.null,col=c(2,3),xlab='DIF size', ylab='H0 rejection proportion in target scenario',main='DIF on 3 items',ylim=c(0,1)) res.null3 <- res.null[res.null$dif.size==0.3,] points(y=res.null3$h0.rejected.p,x=rep(1,nrow(res.null3)),col='#590b0c',pch=3) res.null5 <- res.null[res.null$dif.size==0.5,] points(y=res.null5$h0.rejected.p,x=rep(2,nrow(res.null5)),col='#053305',pch=3) par(mfrow=c(1,1)) par(mfrow=c(2,2)) # 0 item res.null <- res.dat[res.dat$eff.size==0 & res.dat$nb.dif==0 & res.dat$J==4,] boxplot(h0.rejected.p~dif.size,data=res.null,col=c(2),xlab='DIF size', ylab='H0 rejection proportion in target scenario',main='No DIF',ylim=c(0,1)) points(y=res.null$h0.rejected.p,x=rep(1,nrow(res.null)),col='#590b0c',pch=3) # 1 item res.null <- res.dat[res.dat$eff.size==0 & res.dat$nb.dif==1 & res.dat$J==4,] boxplot(h0.rejected.p~dif.size,data=res.null,col=c(2,3),xlab='DIF size', ylab='H0 rejection proportion in target scenario',main='DIF on 1 item',ylim=c(0,1)) res.null3 <- res.null[res.null$dif.size==0.3,] points(y=res.null3$h0.rejected.p,x=rep(1,nrow(res.null3)),col='#590b0c',pch=3) res.null5 <- res.null[res.null$dif.size==0.5,] points(y=res.null5$h0.rejected.p,x=rep(2,nrow(res.null5)),col='#053305',pch=3) # 2 items res.null <- res.dat[res.dat$eff.size==0 & res.dat$nb.dif==2 & res.dat$J==4,] boxplot(h0.rejected.p~dif.size,data=res.null,col=c(2,3),xlab='DIF size', ylab='H0 rejection proportion in target scenario',main='DIF on 2 items',ylim=c(0,1)) res.null3 <- res.null[res.null$dif.size==0.3,] points(y=res.null3$h0.rejected.p,x=rep(1,nrow(res.null3)),col='#590b0c',pch=3) res.null5 <- res.null[res.null$dif.size==0.5,] points(y=res.null5$h0.rejected.p,x=rep(2,nrow(res.null5)),col='#053305',pch=3) par(mfrow=c(1,1)) par(mfrow=c(2,2)) # 0 item res.null <- res.dat[res.dat$eff.size==0 & res.dat$nb.dif==0 & res.dat$J==7,] nrow(res.null) boxplot(h0.rejected.p~dif.size,data=res.null,col=c(2),xlab='DIF size', ylab='H0 rejection proportion in target scenario',main='No DIF',ylim=c(0,1)) points(y=res.null$h0.rejected.p,x=rep(1,nrow(res.null)),col='#590b0c',pch=3) # 2 items res.null <- res.dat[res.dat$eff.size==0 & res.dat$nb.dif==2 & res.dat$J==7,] boxplot(h0.rejected.p~dif.size,data=res.null,col=c(2,3),xlab='DIF size', ylab='H0 rejection proportion in target scenario',main='DIF on 2 items',ylim=c(0,1)) res.null3 <- res.null[res.null$dif.size==0.3,] points(y=res.null3$h0.rejected.p,x=rep(1,nrow(res.null3)),col='#590b0c',pch=3) res.null5 <- res.null[res.null$dif.size==0.5,] points(y=res.null5$h0.rejected.p,x=rep(2,nrow(res.null5)),col='#053305',pch=3) # 3 items res.null <- res.dat[res.dat$eff.size==0 & res.dat$nb.dif==3 & res.dat$J==7,] boxplot(h0.rejected.p~dif.size,data=res.null,col=c(2,3),xlab='DIF size', ylab='H0 rejection proportion in target scenario',main='DIF on 3 items',ylim=c(0,1)) res.null3 <- res.null[res.null$dif.size==0.3,] points(y=res.null3$h0.rejected.p,x=rep(1,nrow(res.null3)),col='#590b0c',pch=3) res.null5 <- res.null[res.null$dif.size==0.5,] points(y=res.null5$h0.rejected.p,x=rep(2,nrow(res.null5)),col='#053305',pch=3) par(mfrow=c(1,1)) par(mfrow=c(2,2)) # 0 item res.null <- res.dat[res.dat$eff.size==0 & res.dat$nb.dif==0 & res.dat$J==7,] nrow(res.null) boxplot(h0.rejected.p~dif.size,data=res.null,col=c(2),xlab='DIF size', ylab='H0 rejection proportion in target scenario',main='No DIF',ylim=c(0,1)) points(y=res.null$h0.rejected.p,x=rep(1,nrow(res.null)),col='#590b0c',pch=3) # 2 items res.null <- res.dat[res.dat$eff.size==0 & res.dat$nb.dif==2 & res.dat$J==7,] boxplot(h0.rejected.p~dif.size,data=res.null,col=c(2,3),xlab='DIF size', ylab='H0 rejection proportion in target scenario',main='DIF on 2 items',ylim=c(0,1)) res.null3 <- res.null[res.null$dif.size==0.3,] points(y=res.null3$h0.rejected.p,x=rep(1,nrow(res.null3)),col='#590b0c',pch=3) res.null5 <- res.null[res.null$dif.size==0.5,] points(y=res.null5$h0.rejected.p,x=rep(2,nrow(res.null5)),col='#053305',pch=3) # 3 items res.null <- res.dat[res.dat$eff.size==0 & res.dat$nb.dif==3 & res.dat$J==7,] boxplot(h0.rejected.p~dif.size,data=res.null,col=c(2,3),xlab='DIF size', ylab='H0 rejection proportion in target scenario',main='DIF on 3 items',ylim=c(0,1)) res.null3 <- res.null[res.null$dif.size==0.3,] points(y=res.null3$h0.rejected.p,x=rep(1,nrow(res.null3)),col='#590b0c',pch=3) res.null5 <- res.null[res.null$dif.size==0.5,] points(y=res.null5$h0.rejected.p,x=rep(2,nrow(res.null5)),col='#053305',pch=3) par(mfrow=c(1,1)) par(mfrow=c(2,2)) # 0 item res.null <- res.dat[res.dat$eff.size==0 & res.dat$nb.dif==0 & res.dat$J==4,] boxplot(h0.rejected.p~dif.size,data=res.null,col=c(2),xlab='DIF size', ylab='H0 rejection proportion in target scenario',main='No DIF',ylim=c(0,1)) points(y=res.null$h0.rejected.p,x=rep(1,nrow(res.null)),col='#590b0c',pch=3) # 1 item res.null <- res.dat[res.dat$eff.size==0 & res.dat$nb.dif==1 & res.dat$J==4,] boxplot(h0.rejected.p~dif.size,data=res.null,col=c(2,3),xlab='DIF size', ylab='H0 rejection proportion in target scenario',main='DIF on 1 item',ylim=c(0,1)) res.null3 <- res.null[res.null$dif.size==0.3,] points(y=res.null3$h0.rejected.p,x=rep(1,nrow(res.null3)),col='#590b0c',pch=3) res.null5 <- res.null[res.null$dif.size==0.5,] points(y=res.null5$h0.rejected.p,x=rep(2,nrow(res.null5)),col='#053305',pch=3) # 2 items res.null <- res.dat[res.dat$eff.size==0 & res.dat$nb.dif==2 & res.dat$J==4,] boxplot(h0.rejected.p~dif.size,data=res.null,col=c(2,3),xlab='DIF size', ylab='H0 rejection proportion in target scenario',main='DIF on 2 items',ylim=c(0,1)) res.null3 <- res.null[res.null$dif.size==0.3,] points(y=res.null3$h0.rejected.p,x=rep(1,nrow(res.null3)),col='#590b0c',pch=3) res.null5 <- res.null[res.null$dif.size==0.5,] points(y=res.null5$h0.rejected.p,x=rep(2,nrow(res.null5)),col='#053305',pch=3) par(mfrow=c(1,1)) par(mfrow=c(2,2)) # 0 item res.null <- res.dat[res.dat$eff.size==0 & res.dat$nb.dif==0 & res.dat$J==7,] nrow(res.null) boxplot(h0.rejected.p~dif.size,data=res.null,col=c(2),xlab='DIF size', ylab='H0 rejection proportion in target scenario',main='No DIF',ylim=c(0,1)) points(y=res.null$h0.rejected.p,x=rep(1,nrow(res.null)),col='#590b0c',pch=3) # 2 items res.null <- res.dat[res.dat$eff.size==0 & res.dat$nb.dif==2 & res.dat$J==7,] boxplot(h0.rejected.p~dif.size,data=res.null,col=c(2,3),xlab='DIF size', ylab='H0 rejection proportion in target scenario',main='DIF on 2 items',ylim=c(0,1)) res.null3 <- res.null[res.null$dif.size==0.3,] points(y=res.null3$h0.rejected.p,x=rep(1,nrow(res.null3)),col='#590b0c',pch=3) res.null5 <- res.null[res.null$dif.size==0.5,] points(y=res.null5$h0.rejected.p,x=rep(2,nrow(res.null5)),col='#053305',pch=3) # 3 items res.null <- res.dat[res.dat$eff.size==0 & res.dat$nb.dif==3 & res.dat$J==7,] boxplot(h0.rejected.p~dif.size,data=res.null,col=c(2,3),xlab='DIF size', ylab='H0 rejection proportion in target scenario',main='DIF on 3 items',ylim=c(0,1)) res.null3 <- res.null[res.null$dif.size==0.3,] points(y=res.null3$h0.rejected.p,x=rep(1,nrow(res.null3)),col='#590b0c',pch=3) res.null5 <- res.null[res.null$dif.size==0.5,] points(y=res.null5$h0.rejected.p,x=rep(2,nrow(res.null5)),col='#053305',pch=3) par(mfrow=c(1,1)) # Overall boxplot(beta.same.sign.truebeta.p~dif.size,data=res.dat,col=c(2,3),xlab='DIF size', ylab='Proportion of estimates with same sign as true value in target scenario',main='DIF on 3 items',ylim=c(0,1)) res.null3 <- res.dat[res.dat$dif.size==-0.5,] points(y=res.null3$beta.same.sign.truebeta.p,x=rep(1,nrow(res.null3)),col='#590b0c',pch=3) res.null3 <- res.dat[res.dat$dif.size==0.5,] points(y=res.null3$beta.same.sign.truebeta.p,x=rep(5,nrow(res.null3)),col='#590b0c',pch=3) res.null3 <- res.dat[res.dat$dif.size==-0.3,] points(y=res.null3$beta.same.sign.truebeta.p,x=rep(2,nrow(res.null3)),col='#053305',pch=3) res.null3 <- res.dat[res.dat$dif.size==0.3,] points(y=res.null3$beta.same.sign.truebeta.p,x=rep(4,nrow(res.null3)),col='#053305',pch=3) res.null3 <- res.dat[res.dat$dif.size==0,] points(y=res.null3$beta.same.sign.truebeta.p,x=rep(3,nrow(res.null3)),col='gray',pch=3) #### Create data.frame results <- c(sapply(1:4,function(x) paste0(x,c('A','B','C','D','E'))),sapply(5:9,function(x) paste0(x,c('A','B','C','D','E','F','G')))) results2 <- c(sapply(10:20,function(x) paste0(x,c('A','B','C','D','E','F','G')))) results <- c(sapply(c(100,200,300),function(x) paste0(results,'_',x))) results2 <- c(sapply(c(100,200,300),function(x) paste0(results2,'_',x))) results <- sort(results) results2 <- sort(results2) results <- c(results,results2) #### Compiler function compile_simulation <- function(scenario) { name <- as.numeric(gsub("[^0-9.-]", "", substr(scenario,start=0,stop=2))) if (substr(scenario,start=nchar(scenario)-2,stop=nchar(scenario))=="100" & name<=4) { s <- read.csv(paste0('/home/corentin/Documents/These/Recherche/Simulations/Analysis/NoDIF/N100/scenario_',scenario,'.csv')) } if (substr(scenario,start=nchar(scenario)-2,stop=nchar(scenario))=="100" & name>4) { s <- read.csv(paste0('/home/corentin/Documents/These/Recherche/Simulations/Analysis/NoDIF/N100/scenario_',scenario,'_nodif.csv')) } if (substr(scenario,start=nchar(scenario)-2,stop=nchar(scenario))=="200" & name<=4) { s <- read.csv(paste0('/home/corentin/Documents/These/Recherche/Simulations/Analysis/NoDIF/N200/scenario_',scenario,'.csv')) } if (substr(scenario,start=nchar(scenario)-2,stop=nchar(scenario))=="200" & name>4) { s <- read.csv(paste0('/home/corentin/Documents/These/Recherche/Simulations/Analysis/NoDIF/N200/scenario_',scenario,'_nodif.csv')) } if (substr(scenario,start=nchar(scenario)-2,stop=nchar(scenario))=="300" & name<=4) { s <- read.csv(paste0('/home/corentin/Documents/These/Recherche/Simulations/Analysis/NoDIF/N300/scenario_',scenario,'.csv')) } if (substr(scenario,start=nchar(scenario)-2,stop=nchar(scenario))=="300" & name>4) { s <- read.csv(paste0('/home/corentin/Documents/These/Recherche/Simulations/Analysis/NoDIF/N300/scenario_',scenario,'_nodif.csv')) } if (unique(s$J)==4) { if (unique(s$M)==2) { a <- data.frame(m.item1=mean(s$item1),m.item2=mean(s$item2),m.item3=mean(s$item3),m.item4=mean(s$item4)) } else { a <- data.frame(m.item1_1=mean(s$item1_1),m.item1_2=mean(s$item1_2),m.item1_3=mean(s$item1_3), m.item2_1=mean(s$item2_1),m.item2_2=mean(s$item2_2),m.item2_3=mean(s$item2_3), m.item3_1=mean(s$item3_1),m.item3_2=mean(s$item3_2),m.item3_3=mean(s$item3_3), m.item4_1=mean(s$item4_1),m.item4_2=mean(s$item4_2),m.item4_3=mean(s$item4_3) ) } } else { if (unique(s$M)==2) { a <- data.frame(m.item1=mean(s$item1),m.item2=mean(s$item2),m.item3=mean(s$item3),m.item4=mean(s$item4), m.item5=mean(s$item5),m.item6=mean(s$item6),m.item7=mean(s$item7)) } else { a <- data.frame(m.item1_1=mean(s$item1_1),m.item1_2=mean(s$item1_2),m.item1_3=mean(s$item1_3), m.item2_1=mean(s$item2_1),m.item2_2=mean(s$item2_2),m.item2_3=mean(s$item2_3), m.item3_1=mean(s$item3_1),m.item3_2=mean(s$item3_2),m.item3_3=mean(s$item3_3), m.item4_1=mean(s$item4_1),m.item4_2=mean(s$item4_2),m.item4_3=mean(s$item4_3), m.item5_1=mean(s$item5_1),m.item5_2=mean(s$item5_2),m.item5_3=mean(s$item5_3), m.item6_1=mean(s$item6_1),m.item6_2=mean(s$item6_2),m.item6_3=mean(s$item6_3), m.item7_1=mean(s$item7_1),m.item7_2=mean(s$item7_2),m.item7_3=mean(s$item7_3) ) } } zz <- substr(scenario,start=0,stop=nchar(scenario)-4) b <- data.frame(scenario=zz, scenario.type=substr(zz,start=nchar(zz),stop=nchar(zz)), N=substr(scenario,start=nchar(scenario)-2,stop=nchar(scenario)), J=unique(s$J), M=unique(s$M), eff.size=unique(s$eff.size), nb.dif=unique(s$nb.dif), dif.size=unique(s$dif.size) ) z <- data.frame(m.beta=mean(s$beta), se.empirical.beta=sd(s$beta), se.analytical.beta=mean(s$se.beta), m.low.ci.beta=mean(s$low.ci.beta), m.high.ci.beta=mean(s$high.ci.beta), true.value.in.ci.p=mean(s$true.value.in.ci), h0.rejected.p=mean(s$h0.rejected), beta.same.sign.truebeta.p=mean(s$beta.same.sign.truebeta,na.rm=T), beta.same.sign.truebeta.signif.p=mean(s[s$h0.rejected==1,]$beta.same.sign.truebeta,na.rm=T)) d <- cbind(b,a,z) d$prop. return(d) } #### Compiled results res.dat <- compile_simulation('1A_100') for (x in results[seq(2,length(results))]) { y <- compile_simulation(x) res.dat <- bind_rows(res.dat,y) } library(TAM) library(doMC) library(parallel) library(pbmcapply) library(funprog) library(dplyr) #### Create data.frame results <- c(sapply(1:4,function(x) paste0(x,c('A','B','C','D','E'))),sapply(5:9,function(x) paste0(x,c('A','B','C','D','E','F','G')))) results2 <- c(sapply(10:20,function(x) paste0(x,c('A','B','C','D','E','F','G')))) results <- c(sapply(c(100,200,300),function(x) paste0(results,'_',x))) results2 <- c(sapply(c(100,200,300),function(x) paste0(results2,'_',x))) results <- sort(results) results2 <- sort(results2) results <- c(results,results2) #### Compiler function compile_simulation <- function(scenario) { name <- as.numeric(gsub("[^0-9.-]", "", substr(scenario,start=0,stop=2))) if (substr(scenario,start=nchar(scenario)-2,stop=nchar(scenario))=="100" & name<=4) { s <- read.csv(paste0('/home/corentin/Documents/These/Recherche/Simulations/Analysis/NoDIF/N100/scenario_',scenario,'.csv')) } if (substr(scenario,start=nchar(scenario)-2,stop=nchar(scenario))=="100" & name>4) { s <- read.csv(paste0('/home/corentin/Documents/These/Recherche/Simulations/Analysis/NoDIF/N100/scenario_',scenario,'_nodif.csv')) } if (substr(scenario,start=nchar(scenario)-2,stop=nchar(scenario))=="200" & name<=4) { s <- read.csv(paste0('/home/corentin/Documents/These/Recherche/Simulations/Analysis/NoDIF/N200/scenario_',scenario,'.csv')) } if (substr(scenario,start=nchar(scenario)-2,stop=nchar(scenario))=="200" & name>4) { s <- read.csv(paste0('/home/corentin/Documents/These/Recherche/Simulations/Analysis/NoDIF/N200/scenario_',scenario,'_nodif.csv')) } if (substr(scenario,start=nchar(scenario)-2,stop=nchar(scenario))=="300" & name<=4) { s <- read.csv(paste0('/home/corentin/Documents/These/Recherche/Simulations/Analysis/NoDIF/N300/scenario_',scenario,'.csv')) } if (substr(scenario,start=nchar(scenario)-2,stop=nchar(scenario))=="300" & name>4) { s <- read.csv(paste0('/home/corentin/Documents/These/Recherche/Simulations/Analysis/NoDIF/N300/scenario_',scenario,'_nodif.csv')) } if (unique(s$J)==4) { if (unique(s$M)==2) { a <- data.frame(m.item1=mean(s$item1),m.item2=mean(s$item2),m.item3=mean(s$item3),m.item4=mean(s$item4)) } else { a <- data.frame(m.item1_1=mean(s$item1_1),m.item1_2=mean(s$item1_2),m.item1_3=mean(s$item1_3), m.item2_1=mean(s$item2_1),m.item2_2=mean(s$item2_2),m.item2_3=mean(s$item2_3), m.item3_1=mean(s$item3_1),m.item3_2=mean(s$item3_2),m.item3_3=mean(s$item3_3), m.item4_1=mean(s$item4_1),m.item4_2=mean(s$item4_2),m.item4_3=mean(s$item4_3) ) } } else { if (unique(s$M)==2) { a <- data.frame(m.item1=mean(s$item1),m.item2=mean(s$item2),m.item3=mean(s$item3),m.item4=mean(s$item4), m.item5=mean(s$item5),m.item6=mean(s$item6),m.item7=mean(s$item7)) } else { a <- data.frame(m.item1_1=mean(s$item1_1),m.item1_2=mean(s$item1_2),m.item1_3=mean(s$item1_3), m.item2_1=mean(s$item2_1),m.item2_2=mean(s$item2_2),m.item2_3=mean(s$item2_3), m.item3_1=mean(s$item3_1),m.item3_2=mean(s$item3_2),m.item3_3=mean(s$item3_3), m.item4_1=mean(s$item4_1),m.item4_2=mean(s$item4_2),m.item4_3=mean(s$item4_3), m.item5_1=mean(s$item5_1),m.item5_2=mean(s$item5_2),m.item5_3=mean(s$item5_3), m.item6_1=mean(s$item6_1),m.item6_2=mean(s$item6_2),m.item6_3=mean(s$item6_3), m.item7_1=mean(s$item7_1),m.item7_2=mean(s$item7_2),m.item7_3=mean(s$item7_3) ) } } zz <- substr(scenario,start=0,stop=nchar(scenario)-4) b <- data.frame(scenario=zz, scenario.type=substr(zz,start=nchar(zz),stop=nchar(zz)), N=substr(scenario,start=nchar(scenario)-2,stop=nchar(scenario)), J=unique(s$J), M=unique(s$M), eff.size=unique(s$eff.size), nb.dif=unique(s$nb.dif), dif.size=unique(s$dif.size) ) z <- data.frame(m.beta=mean(s$beta), se.empirical.beta=sd(s$beta), se.analytical.beta=mean(s$se.beta), m.low.ci.beta=mean(s$low.ci.beta), m.high.ci.beta=mean(s$high.ci.beta), true.value.in.ci.p=mean(s$true.value.in.ci), h0.rejected.p=mean(s$h0.rejected), beta.same.sign.truebeta.p=mean(s$beta.same.sign.truebeta,na.rm=T), beta.same.sign.truebeta.signif.p=mean(s[s$h0.rejected==1,]$beta.same.sign.truebeta,na.rm=T)) d <- cbind(b,a,z) d$prop. return(d) } #### Compiled results res.dat <- compile_simulation('1A_100') for (x in results[seq(2,length(results))]) { y <- compile_simulation(x) res.dat <- bind_rows(res.dat,y) } res.dat[res.dat$scenario.type=='A','dif.size'] <- -res.dat[res.dat$scenario.type=='A','dif.size'] res.dat[is.na(res.dat$dif.size),'dif.size'] <- 0 res.dat[132:300,'nb.dif'] <- 2 res.dat[300:396,'nb.dif'] <- 3 res.dat.simple <- res.dat[,c(1:8,13,16:18)] res.dat.simple$m.beta <- round(res.dat.simple$m.beta,3) res.dat.simple boxplot(beta.same.sign.truebeta.signif.p~dif.size,data=res.dat,col=c(2,3),xlab='DIF size', ylab='Proportion of estimates with same sign as true value in target scenario',main='DIF on 3 items',ylim=c(0,1)) res.null3 <- res.dat[res.dat$dif.size==-0.5,] points(y=res.null3$beta.same.sign.truebeta.p,x=rep(1,nrow(res.null3)),col='#590b0c',pch=3) res.null3 <- res.dat[res.dat$dif.size==0.5,] points(y=res.null3$beta.same.sign.truebeta.p,x=rep(5,nrow(res.null3)),col='#590b0c',pch=3) res.null3 <- res.dat[res.dat$dif.size==-0.3,] points(y=res.null3$beta.same.sign.truebeta.p,x=rep(2,nrow(res.null3)),col='#053305',pch=3) res.null3 <- res.dat[res.dat$dif.size==0.3,] points(y=res.null3$beta.same.sign.truebeta.p,x=rep(4,nrow(res.null3)),col='#053305',pch=3) res.null3 <- res.dat[res.dat$dif.size==0,] points(y=res.null3$beta.same.sign.truebeta.p,x=rep(3,nrow(res.null3)),col='gray',pch=3) boxplot(beta.same.sign.truebeta.signif.p~dif.size,data=res.dat,col=c(2,3),xlab='DIF size', ylab='Proportion of estimates with same sign as true value in target scenario',main='DIF on 3 items',ylim=c(0,1)) res.null3 <- res.dat[res.dat$dif.size==-0.5,] points(y=res.null3$beta.same.sign.truebeta.signif.p,x=rep(1,nrow(res.null3)),col='#590b0c',pch=3) res.null3 <- res.dat[res.dat$dif.size==0.5,] points(y=res.null3$beta.same.sign.truebeta.signif.p,x=rep(5,nrow(res.null3)),col='#590b0c',pch=3) res.null3 <- res.dat[res.dat$dif.size==-0.3,] points(y=res.null3$beta.same.sign.truebeta.signif.p,x=rep(2,nrow(res.null3)),col='#053305',pch=3) res.null3 <- res.dat[res.dat$dif.size==0.3,] points(y=res.null3$beta.same.sign.truebeta.signif.p,x=rep(4,nrow(res.null3)),col='#053305',pch=3) res.null3 <- res.dat[res.dat$dif.size==0,] points(y=res.null3$beta.same.sign.truebeta.signif.p,x=rep(3,nrow(res.null3)),col='gray',pch=3) ## Proportion of rejected h0 per dif value in h0 scenarios (A) by DIF size res.null <- res.dat[res.dat$eff.size!=0,] boxplot(h0.rejected.p~dif.size,data=res.null,col=c(3,2,1),xlab='DIF size',ylab='H0 rejection proportion in target scenario') res.null0 <- res.dat[res.dat$eff.size!=0 & res.dat$dif.size==0,] points(y=res.null0$h0.rejected.p,x=rep(3,nrow(res.null0)),col='gray',pch=3) res.null3 <- res.dat[res.dat$eff.size!=0 & res.dat$dif.size==-0.3,] points(y=res.null3$h0.rejected.p,x=rep(2,nrow(res.null3)),col='#590b0c',pch=3) res.null5 <- res.dat[res.dat$eff.size!=0 & res.dat$dif.size==-0.5,] points(y=res.null5$h0.rejected.p,x=rep(1,nrow(res.null5)),col='#053305',pch=3) res.null <- res.dat[res.dat$eff.size>0,] boxplot(h0.rejected.p~dif.size,data=res.null,col=c(3,2,1),xlab='DIF size',ylab='H0 rejection proportion in target scenario') res.null0 <- res.dat[res.dat$eff.size>0 & res.dat$dif.size==0,] points(y=res.null0$h0.rejected.p,x=rep(3,nrow(res.null0)),col='gray',pch=3) res.null3 <- res.dat[res.dat$eff.size>0 & res.dat$dif.size==-0.3,] points(y=res.null3$h0.rejected.p,x=rep(2,nrow(res.null3)),col='#590b0c',pch=3) res.null5 <- res.dat[res.dat$eff.size>0 & res.dat$dif.size==-0.5,] points(y=res.null5$h0.rejected.p,x=rep(1,nrow(res.null5)),col='#053305',pch=3) res.null <- res.dat[res.dat$eff.size>0,] boxplot(h0.rejected.p~dif.size,data=res.null,col=c(3,2,4,2,3),xlab='DIF size',ylab='H0 rejection proportion in target scenario') res.null0 <- res.dat[res.dat$eff.size>0 & res.dat$dif.size==0,] points(y=res.null0$h0.rejected.p,x=rep(3,nrow(res.null0)),col='gray',pch=3) res.null3 <- res.dat[res.dat$eff.size>0 & res.dat$dif.size==-0.3,] points(y=res.null3$h0.rejected.p,x=rep(2,nrow(res.null3)),col='#590b0c',pch=3) res.null5 <- res.dat[res.dat$eff.size>0 & res.dat$dif.size==-0.5,] points(y=res.null5$h0.rejected.p,x=rep(1,nrow(res.null5)),col='#053305',pch=3) res.null <- res.dat[res.dat$eff.size>0,] boxplot(h0.rejected.p~dif.size,data=res.null,col=c(3,2,4,2,3),xlab='DIF size',ylab='H0 rejection proportion in target scenario') res.null0 <- res.dat[res.dat$eff.size>0 & res.dat$dif.size==0,] points(y=res.null0$h0.rejected.p,x=rep(3,nrow(res.null0)),col='darkblue',pch=3) res.null3 <- res.dat[res.dat$eff.size>0 & res.dat$dif.size==-0.3,] points(y=res.null3$h0.rejected.p,x=rep(2,nrow(res.null3)),col='#590b0c',pch=3) res.null5 <- res.dat[res.dat$eff.size>0 & res.dat$dif.size==-0.5,] points(y=res.null5$h0.rejected.p,x=rep(1,nrow(res.null5)),col='#053305',pch=3) res.null <- res.dat[res.dat$eff.size>0,] boxplot(h0.rejected.p~dif.size,data=res.null,col=c(3,2,4,2,3),xlab='DIF size',ylab='H0 rejection proportion in target scenario') res.null0 <- res.dat[res.dat$eff.size>0 & res.dat$dif.size==0,] points(y=res.null0$h0.rejected.p,x=rep(3,nrow(res.null0)),col='darkblue',pch=3) res.null3 <- res.dat[res.dat$eff.size>0 & res.dat$dif.size==-0.3,] points(y=res.null3$h0.rejected.p,x=rep(2,nrow(res.null3)),col='#590b0c',pch=3) res.null5 <- res.dat[res.dat$eff.size>0 & res.dat$dif.size==-0.5,] points(y=res.null5$h0.rejected.p,x=rep(1,nrow(res.null5)),col='#053305',pch=3) res.null3 <- res.dat[res.dat$eff.size>0 & res.dat$dif.size==0.3,] points(y=res.null3$h0.rejected.p,x=rep(4,nrow(res.null3)),col='#590b0c',pch=3) res.null5 <- res.dat[res.dat$eff.size>0 & res.dat$dif.size==0.5,] points(y=res.null5$h0.rejected.p,x=rep(5,nrow(res.null5)),col='#053305',pch=3) res.null <- res.dat[res.dat$eff.size>0 & res.dat$N==100,] boxplot(h0.rejected.p~dif.size,data=res.null,col=c(3,2,4,2,3),xlab='DIF size',ylab='H0 rejection proportion in target scenario') res.null0 <- res.dat[res.dat$eff.size>0 & res.dat$dif.size==0 & res.dat$N==100,] points(y=res.null0$h0.rejected.p,x=rep(3,nrow(res.null0)),col='darkblue',pch=3) res.null3 <- res.dat[res.dat$eff.size>0 & res.dat$dif.size==-0.3 & res.dat$N==100,] points(y=res.null3$h0.rejected.p,x=rep(2,nrow(res.null3)),col='#590b0c',pch=3) res.null5 <- res.dat[res.dat$eff.size>0 & res.dat$dif.size==-0.5 & res.dat$N==100,] points(y=res.null5$h0.rejected.p,x=rep(1,nrow(res.null5)),col='#053305',pch=3) res.null3 <- res.dat[res.dat$eff.size>0 & res.dat$dif.size==0.3 & res.dat$N==100,] points(y=res.null3$h0.rejected.p,x=rep(4,nrow(res.null3)),col='#590b0c',pch=3) res.null5 <- res.dat[res.dat$eff.size>0 & res.dat$dif.size==0.5 & res.dat$N==100,] points(y=res.null5$h0.rejected.p,x=rep(5,nrow(res.null5)),col='#053305',pch=3) res.null <- res.dat[res.dat$eff.size>0 & res.dat$N==300,] boxplot(h0.rejected.p~dif.size,data=res.null,col=c(3,2,4,2,3),xlab='DIF size',ylab='H0 rejection proportion in target scenario') res.null0 <- res.dat[res.dat$eff.size>0 & res.dat$dif.size==0 & res.dat$N==300,] points(y=res.null0$h0.rejected.p,x=rep(3,nrow(res.null0)),col='darkblue',pch=3) res.null3 <- res.dat[res.dat$eff.size>0 & res.dat$dif.size==-0.3 & res.dat$N==300,] points(y=res.null3$h0.rejected.p,x=rep(2,nrow(res.null3)),col='#590b0c',pch=3) res.null5 <- res.dat[res.dat$eff.size>0 & res.dat$dif.size==-0.5 & res.dat$N==300,] points(y=res.null5$h0.rejected.p,x=rep(1,nrow(res.null5)),col='#053305',pch=3) res.null3 <- res.dat[res.dat$eff.size>0 & res.dat$dif.size==0.3 & res.dat$N==300,] points(y=res.null3$h0.rejected.p,x=rep(4,nrow(res.null3)),col='#590b0c',pch=3) res.null5 <- res.dat[res.dat$eff.size>0 & res.dat$dif.size==0.5 & res.dat$N==300,] points(y=res.null5$h0.rejected.p,x=rep(5,nrow(res.null5)),col='#053305',pch=3) ############# By N // EFF SIZE NEGATIVE ####### N=100 res.null <- res.dat[res.dat$eff.size<0 & res.dat$N==100,] boxplot(h0.rejected.p~dif.size,data=res.null,col=c(3,2,4,2,3),xlab='DIF size',ylab='H0 rejection proportion in target scenario') res.null0 <- res.dat[res.dat$eff.size<0 & res.dat$dif.size==0 & res.dat$N==100,] points(y=res.null0$h0.rejected.p,x=rep(3,nrow(res.null0)),col='darkblue',pch=3) res.null3 <- res.dat[res.dat$eff.size<0 & res.dat$dif.size==-0.3 & res.dat$N==100,] points(y=res.null3$h0.rejected.p,x=rep(2,nrow(res.null3)),col='#590b0c',pch=3) res.null5 <- res.dat[res.dat$eff.size<0 & res.dat$dif.size==-0.5 & res.dat$N==100,] points(y=res.null5$h0.rejected.p,x=rep(1,nrow(res.null5)),col='#053305',pch=3) res.null3 <- res.dat[res.dat$eff.size<0 & res.dat$dif.size==0.3 & res.dat$N==100,] points(y=res.null3$h0.rejected.p,x=rep(4,nrow(res.null3)),col='#590b0c',pch=3) res.null5 <- res.dat[res.dat$eff.size<0 & res.dat$dif.size==0.5 & res.dat$N==100,] points(y=res.null5$h0.rejected.p,x=rep(5,nrow(res.null5)),col='#053305',pch=3) ####### N=300 // DIF à 0.5 - QUELS SONT LES SCENARIOS EN HAUT res.null <- res.dat[res.dat$eff.size<0 & res.dat$N==300,] boxplot(h0.rejected.p~dif.size,data=res.null,col=c(3,2,4,2,3),xlab='DIF size',ylab='H0 rejection proportion in target scenario') res.null0 <- res.dat[res.dat$eff.size<0 & res.dat$dif.size==0 & res.dat$N==300,] points(y=res.null0$h0.rejected.p,x=rep(3,nrow(res.null0)),col='darkblue',pch=3) res.null3 <- res.dat[res.dat$eff.size<0 & res.dat$dif.size==-0.3 & res.dat$N==300,] points(y=res.null3$h0.rejected.p,x=rep(2,nrow(res.null3)),col='#590b0c',pch=3) res.null5 <- res.dat[res.dat$eff.size<0 & res.dat$dif.size==-0.5 & res.dat$N==300,] points(y=res.null5$h0.rejected.p,x=rep(1,nrow(res.null5)),col='#053305',pch=3) res.null3 <- res.dat[res.dat$eff.size<0 & res.dat$dif.size==0.3 & res.dat$N==300,] points(y=res.null3$h0.rejected.p,x=rep(4,nrow(res.null3)),col='#590b0c',pch=3) res.null5 <- res.dat[res.dat$eff.size<0 & res.dat$dif.size==0.5 & res.dat$N==300,] points(y=res.null5$h0.rejected.p,x=rep(5,nrow(res.null5)),col='#053305',pch=3) res.null <- res.dat[res.dat$eff.size<0 & res.dat$N==100,] boxplot(h0.rejected.p~dif.size,data=res.null,col=c(3,2,4,2,3),xlab='DIF size',ylab='H0 rejection proportion in target scenario') res.null0 <- res.dat[res.dat$eff.size<0 & res.dat$dif.size==0 & res.dat$N==100,] points(y=res.null0$h0.rejected.p,x=rep(3,nrow(res.null0)),col='darkblue',pch=3) res.null3 <- res.dat[res.dat$eff.size<0 & res.dat$dif.size==-0.3 & res.dat$N==100,] points(y=res.null3$h0.rejected.p,x=rep(2,nrow(res.null3)),col='#590b0c',pch=3) res.null5 <- res.dat[res.dat$eff.size<0 & res.dat$dif.size==-0.5 & res.dat$N==100,] points(y=res.null5$h0.rejected.p,x=rep(1,nrow(res.null5)),col='#053305',pch=3) res.null <- res.dat[res.dat$eff.size<0 & res.dat$N==300,] boxplot(h0.rejected.p~dif.size,data=res.null,col=c(3,2,4,2,3),xlab='DIF size',ylab='H0 rejection proportion in target scenario') res.null0 <- res.dat[res.dat$eff.size<0 & res.dat$dif.size==0 & res.dat$N==300,] points(y=res.null0$h0.rejected.p,x=rep(3,nrow(res.null0)),col='darkblue',pch=3) res.null3 <- res.dat[res.dat$eff.size<0 & res.dat$dif.size==-0.3 & res.dat$N==300,] points(y=res.null3$h0.rejected.p,x=rep(2,nrow(res.null3)),col='#590b0c',pch=3) res.null5 <- res.dat[res.dat$eff.size<0 & res.dat$dif.size==-0.5 & res.dat$N==300,] points(y=res.null5$h0.rejected.p,x=rep(1,nrow(res.null5)),col='#053305',pch=3) res.null <- res.dat[res.dat$eff.size<0 & res.dat$N==100,] boxplot(h0.rejected.p~dif.size,data=res.null,col=c(3,2,4,2,3),xlab='DIF size',ylab='H0 rejection proportion in target scenario') res.null0 <- res.dat[res.dat$eff.size<0 & res.dat$dif.size==0 & res.dat$N==100,] points(y=res.null0$h0.rejected.p,x=rep(3,nrow(res.null0)),col='darkblue',pch=3) res.null3 <- res.dat[res.dat$eff.size<0 & res.dat$dif.size==-0.3 & res.dat$N==100,] points(y=res.null3$h0.rejected.p,x=rep(2,nrow(res.null3)),col='#590b0c',pch=3) res.null5 <- res.dat[res.dat$eff.size<0 & res.dat$dif.size==-0.5 & res.dat$N==100,] points(y=res.null5$h0.rejected.p,x=rep(1,nrow(res.null5)),col='#053305',pch=3) muA=5 muB=10 kappa=1 sd=10 alpha=0.05 beta=0.20 (nB=(1+1/kappa)*(sd*(qnorm(1-alpha/2)+qnorm(1-beta))/(muA-muB))^2) ceiling(nB) # 63 z=(muA-muB)/(sd*sqrt((1+1/kappa)/nB)) (Power=pnorm(z-qnorm(1-alpha/2))+pnorm(-z-qnorm(1-alpha/2))) muA=5 muB=10 kappa=1 sd=10 alpha=0.05 beta=0.20 (nB=(1+1/kappa)*(sd*(qnorm(1-alpha/2)+qnorm(1-beta))/(muA-muB))^2) ceiling(nB) # 63 z=(muA-muB)/(sd*sqrt((1+1/kappa)/nB)) (Power=pnorm(z-qnorm(1-alpha/2))+pnorm(-z-qnorm(1-alpha/2)))