########################## # IGNORING DIF ########################## ########### Power # Prepare res.dat$dif.agrees.tt <- ifelse(res.dat$eff.size!=0 & res.dat$dif.size!=0, res.dat$dif.size/res.dat$eff.size<0,NA) res.dat[res.dat$scenario.type!="A" & res.dat$nb.dif>0 & res.dat$dif.agrees.tt,"dif.power"] <- res.dat[res.dat$scenario.type!="A" & res.dat$nb.dif>0 & res.dat$dif.agrees.tt,]$h0.rejected.p-res.dat[res.dat$scenario.type!="A" & res.dat$nb.dif>0 & res.dat$dif.agrees.tt,]$theoretical.power res.dat[res.dat$scenario.type!="A" & res.dat$nb.dif>0 & !res.dat$dif.agrees.tt,"dif.power"] <- res.dat[res.dat$scenario.type!="A" & res.dat$nb.dif>0 & !res.dat$dif.agrees.tt,]$h0.rejected.p-res.dat[res.dat$scenario.type!="A" & res.dat$nb.dif>0 & !res.dat$dif.agrees.tt,]$theoretical.power # Histo coloré par typo par(mfrow=c(2,1)) hist(res.dat[abs(res.dat$dif.size)==0.3 & !res.dat$dif.agrees.tt,]$dif.power,breaks = seq(-0.7,0.6,0.05),freq=F,xlim = c(-0.7,0.7),ylim=c(0,4),col=rgb(1,0,0,1/4), main="real power - theoretical power in scenarios with DIF size 0.3",xlab="Real power - theoretical power (raw % difference)") hist(res.dat[abs(res.dat$dif.size)==0.3 & res.dat$dif.agrees.tt,]$dif.power,breaks = seq(-0.7,0.6,0.05),freq=F,xlim = c(-0.7,0.7),ylim=c(0,4),col=rgb(0,0,1,1/4),add=T) abline(v=0,lty=2,col="black",lwd=2) hist(res.dat[abs(res.dat$dif.size)==0.5 & !res.dat$dif.agrees.tt,]$dif.power,breaks = seq(-0.7,0.6,0.05),freq=F,xlim = c(-0.7,0.7),ylim=c(0,4),col=rgb(1,0,0,1/4), main="real power - theoretical power in scenarios with DIF size 0.5",xlab="Real power - theoretical power (raw % difference)") hist(res.dat[abs(res.dat$dif.size)==0.5 & res.dat$dif.agrees.tt,]$dif.power,breaks = seq(-0.7,0.6,0.05),freq=F,xlim = c(-0.7,0.7),ylim=c(0,4),col=rgb(0,0,1,1/4),add=T) abline(v=0,lty=2,col="black",lwd=2) par(xpd=NA) legend(x = -0.825,y=6.25,fill = c(rgb(1,0,0,1/4),rgb(0,0,1,1/4)),c('DIF effect contradicts treatment effect',"DIF effect concurs with treatment effect"),ncol=2) par(mfrow=c(1,1)) # DIF and treatment opposite signs summary(res.dat[res.dat$scenario.type!="A" & res.dat$nb.dif>0 & res.dat$dif.agrees.tt,c("dif.power")]) # DIF and treatment same signs summary(res.dat[res.dat$scenario.type!="A" & res.dat$nb.dif>0 & 1-res.dat$dif.agrees.tt,c("dif.power")]) # N=50 vs 300 summary(res.dat[res.dat$scenario.type!="A" & res.dat$N=="50" & res.dat$nb.dif>0 & res.dat$dif.agrees.tt,c("dif.power")]) summary(res.dat[res.dat$scenario.type!="A" & res.dat$N==100 & res.dat$nb.dif>0 & res.dat$dif.agrees.tt,c("dif.power")]) summary(res.dat[res.dat$scenario.type!="A" & res.dat$N==200 & res.dat$nb.dif>0 & res.dat$dif.agrees.tt,c("dif.power")]) summary(res.dat[res.dat$scenario.type!="A" & res.dat$N==300 & res.dat$nb.dif>0 & res.dat$dif.agrees.tt,c("dif.power")]) ########### Treatment effect estimation sign # Overall summary(res.dat[res.dat$scenario.type!="A" & res.dat$nb.dif>0,c("beta.same.sign.truebeta.p")]) # Worst case scenario summary(res.dat[res.dat$scenario.type!="A" & res.dat$nb.dif>0 & res.dat$dif.agrees.tt==FALSE & abs(res.dat$dif.size)>0.3 & abs(res.dat$eff.size)==0.2,c("beta.same.sign.truebeta.signif.p")]) ########### Bias summary(res.dat[res.dat$nb.dif>0,c("bias")]) ########### true value in CI summary(abs(res.dat[res.dat$nb.dif>0,c("true.value.in.ci.p")])) summary(abs(res.dat[res.dat$N=="50" & res.dat$nb.dif>0,c("true.value.in.ci.p")])) ########################## # DETECTION ########################## # Which performed better summary(res.dat.dif.rosali$prop.perfect-res.dat.dif.resali$prop.perfect) # ROSALI better more than 10% ? res.dat.dif.rosali$better <- res.dat.dif.rosali$prop.perfect-res.dat.dif.resali$prop.perfect>0.1 table(res.dat.dif.rosali[res.dat.dif.rosali$better & res.dat.dif.rosali$nb.dif!=0,"scenario.type"]) # ROSALI worse more than 10% ? res.dat.dif.rosali$worse <- res.dat.dif.rosali$prop.perfect-res.dat.dif.resali$prop.perfect< -0.1 res.dat.dif.rosali[res.dat.dif.rosali$worse & res.dat.dif.rosali$nb.dif!=0,] # ROSALI perf per subsc summary(res.dat.dif.rosali[ res.dat.dif.rosali$N==300 & res.dat.dif.rosali$nb.dif>0 & res.dat.dif.rosali$scenario.type%in%c("C","E"),]$prop.perfect) summary(res.dat.dif.rosali[ res.dat.dif.rosali$N==300 & res.dat.dif.rosali$nb.dif>0 & res.dat.dif.rosali$scenario.type%in%c("B","D","F","G"),]$prop.perfect) # AHRM perf per subsc summary(res.dat.dif.resali[ res.dat.dif.resali$N==300 & res.dat.dif.resali$nb.dif>0 & res.dat.dif.resali$scenario.type%in%c("C","E"),]$prop.perfect) summary(res.dat.dif.resali[ res.dat.dif.resali$N==300 & res.dat.dif.resali$nb.dif>0 & res.dat.dif.resali$scenario.type%in%c("B","D","F","G"),]$prop.perfect) # False DIF detect summary(res.dat.dif.rosali[res.dat.dif.rosali$nb.dif==0,"dif.detected"]) summary(res.dat.dif.resali[res.dat.dif.resali$nb.dif==0,"dif.detected"]) # Causal inference NO DIF summary(res.dat.dif.resali[res.dat.dif.resali$nb.dif==0,"bias"]) summary(res.dat.dif.rosali[res.dat.dif.rosali$nb.dif==0,"bias"]) summary(res.dat.dif.rosali[res.dat.dif.rosali$nb.dif==0 & res.dat.dif.rosali$eff.size==0,"h0.rejected.p"]) summary(res.dat.dif.resali[res.dat.dif.resali$nb.dif==0 & res.dat.dif.resali$eff.size==0,"h0.rejected.p"]) summary(res.dat.dif.resali[res.dat.dif.resali$nb.dif==0,"true.value.in.ci.p"]) summary(res.dat.dif.rosali[res.dat.dif.rosali$nb.dif==0,"true.value.in.ci.p"]) ########################## # TABLES DETECT ########################## res.dat.dif.rosali$dif.agrees.tt <- ifelse(res.dat.dif.rosali$eff.size!=0 & res.dat.dif.rosali$dif.size!=0, res.dat.dif.rosali$dif.size/res.dat.dif.rosali$eff.size<0,NA) res.dat.dif.resali$dif.agrees.tt <- ifelse(res.dat.dif.resali$eff.size!=0 & res.dat.dif.resali$dif.size!=0, res.dat.dif.resali$dif.size/res.dat.dif.resali$eff.size<0,NA) res.dat.dif.rosali$dif.dir <- sign(res.dat.dif.rosali$dif.size) res.dat.dif.resali$dif.dir <- sign(res.dat.dif.resali$dif.size) tab3.resali <- res.dat.dif.resali[res.dat.dif.resali$dif.size!=0, c("scenario","N", "dif.detected","prop.perfect","flexible.detect","moreflexible.detect" )] tab3.resali <-reshape(data = tab3.resali,direction = "wide", idvar = c("scenario"),timevar = "N") tab3.rosali <- res.dat.dif.rosali[res.dat.dif.rosali$dif.size!=0, c("scenario","N","J","M","eff.size","dif.size","dif.dir","nb.dif", "dif.detected","prop.perfect","flexible.detect","moreflexible.detect" )] tab3.rosali <-reshape(data = tab3.rosali,direction = "wide", idvar = c("scenario","J","M","eff.size","dif.size","dif.dir","nb.dif"),timevar = "N") tab3 <- merge(tab3.rosali,tab3.resali,by="scenario",suffixes = c(".rosali",".residuals")) tab3 <- rbind(tab3[78:112,],tab3[1:77,]) tab3$dif.size <- abs(tab3$dif.size) write.csv(tab3,"/home/corentin/Documents/These/Valorisation/Articles/Simulations 1/Figures/tab3.csv") ########################## # TABLES CAUSAL ########################## res.dat.dif.rosali$dif.power <- res.dat.dif.rosali$h0.rejected.p-res.dat.dif.rosali$theoretical.power res.dat.dif.resali$dif.power <- res.dat.dif.resali$h0.rejected.p-res.dat.dif.resali$theoretical.power res.dat.dif.rosali$typeI.error <- ifelse(res.dat.dif.rosali$scenario.type=="A",res.dat.dif.rosali$h0.rejected.p,NA) res.dat.dif.rosali$diff.power <- ifelse(res.dat.dif.rosali$scenario.type!="A",res.dat.dif.rosali$dif.power,NA) res.dat.dif.resali$typeI.error <- ifelse(res.dat.dif.resali$scenario.type=="A",res.dat.dif.resali$h0.rejected.p,NA) res.dat.dif.resali$diff.power <- ifelse(res.dat.dif.resali$scenario.type!="A",res.dat.dif.resali$dif.power,NA) tab4.resali <- res.dat.dif.resali[res.dat.dif.resali$dif.size!=0, c("scenario","N", "h0.rejected.p","theoretical.power","true.value.in.ci.p","beta.same.sign.truebeta.p","beta.same.sign.truebeta.signif.p","bias" )] tab4.resali <-reshape(data = tab4.resali,direction = "wide", idvar = c("scenario"),timevar = "N") tab4.rosali <- res.dat.dif.rosali[res.dat.dif.rosali$dif.size!=0, c("scenario","N","J","M","eff.size","dif.size","dif.dir","nb.dif", "h0.rejected.p","theoretical.power","true.value.in.ci.p","beta.same.sign.truebeta.p","beta.same.sign.truebeta.signif.p","bias" )] tab4.rosali <-reshape(data = tab4.rosali,direction = "wide", idvar = c("scenario","J","M","eff.size","dif.size","dif.dir","nb.dif"),timevar = "N") tab4 <- merge(tab4.rosali,tab4.resali,by="scenario",suffixes = c(".rosali",".residuals")) tab4 <- rbind(tab4[78:112,],tab4[1:77,]) tab4$dif.size <- abs(tab4$dif.size) write.csv(tab4,"/home/corentin/Documents/These/Valorisation/Articles/Simulations 1/Figures/tab4.csv") ########################## # TABLES NODIF ########################## tabs2.resali <- res.dat.dif.resali[res.dat.dif.resali$dif.size==0, c("scenario","N", "dif.detected","h0.rejected.p","theoretical.power","true.value.in.ci.p","beta.same.sign.truebeta.p","beta.same.sign.truebeta.signif.p","bias" )] tabs2.resali <-reshape(data = tabs2.resali,direction = "wide", idvar = c("scenario"),timevar = "N") tabs2.rosali <- res.dat.dif.rosali[res.dat.dif.rosali$dif.size==0, c("scenario","N","J","M","eff.size", "dif.detected","h0.rejected.p","theoretical.power","true.value.in.ci.p","beta.same.sign.truebeta.p","beta.same.sign.truebeta.signif.p","bias" )] tabs2.rosali <-reshape(data = tabs2.rosali,direction = "wide", idvar = c("scenario","J","M","eff.size"),timevar = "N") tabs2 <- merge(tabs2.rosali,tabs2.resali,by="scenario",suffixes = c(".rosali",".residuals")) write.csv(tabs2,"/home/corentin/Documents/These/Valorisation/Articles/Simulations 1/Figures/tabs2.csv") ########################## # STATS DIF DETECTION ########################## # sample size summary(tab3$moreflexible.detect.50.rosali) summary(tab3$moreflexible.detect.50.residuals) tab3[which.max(tab3$prop.perfect.50.residuals),] summary(tab3$moreflexible.detect.100.rosali) summary(tab3$moreflexible.detect.100.residuals) summary(tab3[tab3$nb.dif==1,]$moreflexible.detect.100.residuals) summary(tab3[tab3$nb.dif==1,]$moreflexible.detect.100.rosali) summary(tab3$moreflexible.detect.200.rosali) summary(tab3$moreflexible.detect.200.residuals) summary(tab3$moreflexible.detect.300.rosali) summary(tab3$moreflexible.detect.300.residuals) summary(tab3[tab3$nb.dif==1,]$moreflexible.detect.300.rosali) summary(tab3[tab3$nb.dif==1,]$moreflexible.detect.300.residuals) summary(tab3[tab3$nb.dif==3 & tab3$J==7,]$flexible.detect.300.rosali) summary(tab3[tab3$nb.dif==3 & tab3$J==7,]$flexible.detect.300.residuals) summary(tab3[tab3$nb.dif==2 & tab3$J==4,]$prop.perfect.300.rosali) summary(tab3[tab3$nb.dif==2 & tab3$J==4,]$prop.perfect.300.residuals) summary(tab3[tab3$nb.dif==2 & tab3$J==7,]$prop.perfect.300.rosali) summary(tab3[tab3$nb.dif==2 & tab3$J==7,]$prop.perfect.300.residuals) nrow(tab3[tab3$nb.dif==2 & tab3$prop.perfect.300.residuals>0.5,]) nrow(tab3[tab3$nb.dif==2 & tab3$prop.perfect.300.rosali>0.5,]) summary(tab3[tab3$M==2,]$prop.perfect.300.rosali) summary(tab3[tab3$M==2,]$prop.perfect.300.residuals) summary(tab3[tab3$M==4,]$prop.perfect.300.rosali) summary(tab3[tab3$M==4,]$prop.perfect.300.residuals) summary(tab3[tab3$M==2,]$prop.perfect.200.rosali) summary(tab3[tab3$M==2,]$prop.perfect.200.residuals) summary(tab3[tab3$M==4,]$prop.perfect.200.rosali) summary(tab3[tab3$M==4,]$prop.perfect.200.residuals)