Computed theoretical power for N=100 and N=200 scenarios
This commit is contained in:
BIN
RProject/.RData
BIN
RProject/.RData
Binary file not shown.
@ -1,184 +1,3 @@
|
||||
zz <- substr(scenario,start=0,stop=nchar(scenario)-4)
|
||||
N <- substr(scenario,start=nchar(scenario)-2,stop=nchar(scenario))
|
||||
eff.size <- unique(res.dat[res.dat$scenario==zz & res.dat$N==N,'eff.size'])
|
||||
dif.size <- unique(res.dat[res.dat$scenario==zz & res.dat$N==N,'dif.size'])
|
||||
b <- data.frame(scenario=zz,
|
||||
scenario.type=substr(zz,start=nchar(zz),stop=nchar(zz)),
|
||||
N=N,
|
||||
J=J,
|
||||
M=M,
|
||||
eff.size=eff.size,
|
||||
nb.dif=nb.dif,
|
||||
dif.size=dif.size
|
||||
)
|
||||
true.value.in.ci <- eff.size > s$beta+1.96*s$se_beta | eff.size < s$beta-1.96*s$se_beta
|
||||
z <- data.frame(m.beta=mean(s$beta),
|
||||
se.empirical.beta=sd(s$beta),
|
||||
se.analytical.beta=mean(s$se_beta),
|
||||
m.low.ci.beta=mean(s$beta-1.96*s$se_beta),
|
||||
m.high.ci.beta=mean(s$beta+1.96*s$se_beta),
|
||||
true.value.in.ci=mean(true.value.in.ci),
|
||||
h0.rejected.p=mean( (s$beta-1.96*s$se_beta)>0 | (s$beta+1.96*s$se_beta)<0 ))
|
||||
d <- cbind(b,a,z)
|
||||
d$prop.
|
||||
return(d)
|
||||
}
|
||||
#### Compiled results
|
||||
res.dat.dif <- compile_simulation2('5A_100')
|
||||
for (x in results[seq(2,length(results))]) {
|
||||
y <- compile_simulation2(x)
|
||||
res.dat.dif <- bind_rows(res.dat.dif,y)
|
||||
}
|
||||
res.dat.dif
|
||||
#### Create data.frame
|
||||
results <- c(sapply(1:4,function(x) paste0(x,c('A','B','C','D','E'))),sapply(5:9,function(x) paste0(x,c('A','B','C','D','E','F','G'))))
|
||||
results2 <- c(sapply(10:20,function(x) paste0(x,c('A','B','C','D','E','F','G'))))
|
||||
results <- c(sapply(c(100,200,300),function(x) paste0(results,'_',x)))
|
||||
results2 <- c(sapply(c(100,200,300),function(x) paste0(results2,'_',x)))
|
||||
results <- sort(results)
|
||||
results2 <- sort(results2)
|
||||
results <- c(results,results2)[61:396]
|
||||
#### Compiler function
|
||||
compile_simulation2 <- function(scenario) {
|
||||
name <- as.numeric(gsub("[^0-9.-]", "", substr(scenario,start=0,stop=2)))
|
||||
if (substr(scenario,start=nchar(scenario)-2,stop=nchar(scenario))=="100" & name>4) {
|
||||
s <- read_excel(paste0('/home/corentin/Documents/These/Recherche/Simulations/Analysis/DIF/N100/',scenario,'.xls'))
|
||||
}
|
||||
if (substr(scenario,start=nchar(scenario)-2,stop=nchar(scenario))=="200" & name>4) {
|
||||
s <- read_excel(paste0('/home/corentin/Documents/These/Recherche/Simulations/Analysis/DIF/N200/',scenario,'.xls'))
|
||||
}
|
||||
if (substr(scenario,start=nchar(scenario)-2,stop=nchar(scenario))=="300" & name>4) {
|
||||
s <- read_excel(paste0('/home/corentin/Documents/These/Recherche/Simulations/Analysis/DIF/N300/',scenario,'.xls'))
|
||||
}
|
||||
J <- max(which(sapply(1:7,function(x) paste0('item',x) %in% colnames(s) | paste0('item',x,'_1') %in% colnames(s))))
|
||||
M <- 1+sum(sapply(1:3,function(x) paste0('item1_',x) %in% colnames(s) ))
|
||||
if (M==1) {M <- 2}
|
||||
nb.dif <- max(which(sapply(1:3,function(x) paste0('dif',x) %in% colnames(s) | paste0('dif',x,'_1') %in% colnames(s))))
|
||||
if (J==4) {
|
||||
if (M==2) {
|
||||
a <- data.frame(m.item1=mean(s$item1),m.item2=mean(s$item2),m.item3=mean(s$item3),m.item4=mean(s$item4))
|
||||
} else {
|
||||
a <- data.frame(m.item1_1=mean(s$item1_1),m.item1_2=mean(s$item1_2),m.item1_3=mean(s$item1_3),
|
||||
m.item2_1=mean(s$item2_1),m.item2_2=mean(s$item2_2),m.item2_3=mean(s$item2_3),
|
||||
m.item3_1=mean(s$item3_1),m.item3_2=mean(s$item3_2),m.item3_3=mean(s$item3_3),
|
||||
m.item4_1=mean(s$item4_1),m.item4_2=mean(s$item4_2),m.item4_3=mean(s$item4_3)
|
||||
)
|
||||
}
|
||||
} else {
|
||||
if (M==2) {
|
||||
a <- data.frame(m.item1=mean(s$item1),m.item2=mean(s$item2),m.item3=mean(s$item3),m.item4=mean(s$item4),
|
||||
m.item5=mean(s$item5),m.item6=mean(s$item6),m.item7=mean(s$item7))
|
||||
} else {
|
||||
a <- data.frame(m.item1_1=mean(s$item1_1),m.item1_2=mean(s$item1_2),m.item1_3=mean(s$item1_3),
|
||||
m.item2_1=mean(s$item2_1),m.item2_2=mean(s$item2_2),m.item2_3=mean(s$item2_3),
|
||||
m.item3_1=mean(s$item3_1),m.item3_2=mean(s$item3_2),m.item3_3=mean(s$item3_3),
|
||||
m.item4_1=mean(s$item4_1),m.item4_2=mean(s$item4_2),m.item4_3=mean(s$item4_3),
|
||||
m.item5_1=mean(s$item5_1),m.item5_2=mean(s$item5_2),m.item5_3=mean(s$item5_3),
|
||||
m.item6_1=mean(s$item6_1),m.item6_2=mean(s$item6_2),m.item6_3=mean(s$item6_3),
|
||||
m.item7_1=mean(s$item7_1),m.item7_2=mean(s$item7_2),m.item7_3=mean(s$item7_3)
|
||||
)
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
zz <- substr(scenario,start=0,stop=nchar(scenario)-4)
|
||||
N <- substr(scenario,start=nchar(scenario)-2,stop=nchar(scenario))
|
||||
eff.size <- unique(res.dat[res.dat$scenario==zz & res.dat$N==N,'eff.size'])
|
||||
dif.size <- unique(res.dat[res.dat$scenario==zz & res.dat$N==N,'dif.size'])
|
||||
b <- data.frame(scenario=zz,
|
||||
scenario.type=substr(zz,start=nchar(zz),stop=nchar(zz)),
|
||||
N=N,
|
||||
J=J,
|
||||
M=M,
|
||||
eff.size=eff.size,
|
||||
nb.dif=nb.dif,
|
||||
dif.size=dif.size
|
||||
)
|
||||
true.value.in.ci <- eff.size <= s$beta+1.96*s$se_beta & eff.size >= s$beta-1.96*s$se_beta
|
||||
z <- data.frame(m.beta=mean(s$beta),
|
||||
se.empirical.beta=sd(s$beta),
|
||||
se.analytical.beta=mean(s$se_beta),
|
||||
m.low.ci.beta=mean(s$beta-1.96*s$se_beta),
|
||||
m.high.ci.beta=mean(s$beta+1.96*s$se_beta),
|
||||
true.value.in.ci=mean(true.value.in.ci),
|
||||
h0.rejected.p=mean( (s$beta-1.96*s$se_beta)>0 | (s$beta+1.96*s$se_beta)<0 ))
|
||||
d <- cbind(b,a,z)
|
||||
d$prop.
|
||||
return(d)
|
||||
}
|
||||
#### Compiled results
|
||||
res.dat.dif <- compile_simulation2('5A_100')
|
||||
for (x in results[seq(2,length(results))]) {
|
||||
y <- compile_simulation2(x)
|
||||
res.dat.dif <- bind_rows(res.dat.dif,y)
|
||||
}
|
||||
res.dat.dif
|
||||
which((s$beta-1.96*s$se_beta)>0 | (s$beta+1.96*s$se_beta)<0)
|
||||
#### Create data.frame
|
||||
results <- c(sapply(1:4,function(x) paste0(x,c('A','B','C','D','E'))),sapply(5:9,function(x) paste0(x,c('A','B','C','D','E','F','G'))))
|
||||
results2 <- c(sapply(10:20,function(x) paste0(x,c('A','B','C','D','E','F','G'))))
|
||||
results <- c(sapply(c(100,200,300),function(x) paste0(results,'_',x)))
|
||||
results2 <- c(sapply(c(100,200,300),function(x) paste0(results2,'_',x)))
|
||||
results <- sort(results)
|
||||
results2 <- sort(results2)
|
||||
results <- c(results,results2)[61:396]
|
||||
#### Compiler function
|
||||
compile_simulation2 <- function(scenario) {
|
||||
name <- as.numeric(gsub("[^0-9.-]", "", substr(scenario,start=0,stop=2)))
|
||||
if (substr(scenario,start=nchar(scenario)-2,stop=nchar(scenario))=="100" & name>4) {
|
||||
s <- read_excel(paste0('/home/corentin/Documents/These/Recherche/Simulations/Analysis/DIF/N100/',scenario,'.xls'))
|
||||
}
|
||||
if (substr(scenario,start=nchar(scenario)-2,stop=nchar(scenario))=="200" & name>4) {
|
||||
s <- read_excel(paste0('/home/corentin/Documents/These/Recherche/Simulations/Analysis/DIF/N200/',scenario,'.xls'))
|
||||
}
|
||||
if (substr(scenario,start=nchar(scenario)-2,stop=nchar(scenario))=="300" & name>4) {
|
||||
s <- read_excel(paste0('/home/corentin/Documents/These/Recherche/Simulations/Analysis/DIF/N300/',scenario,'.xls'))
|
||||
}
|
||||
J <- max(which(sapply(1:7,function(x) paste0('item',x) %in% colnames(s) | paste0('item',x,'_1') %in% colnames(s))))
|
||||
M <- 1+sum(sapply(1:3,function(x) paste0('item1_',x) %in% colnames(s) ))
|
||||
if (M==1) {M <- 2}
|
||||
nb.dif <- max(which(sapply(1:3,function(x) paste0('dif',x) %in% colnames(s) | paste0('dif',x,'_1') %in% colnames(s))))
|
||||
if (J==4) {
|
||||
if (M==2) {
|
||||
a <- data.frame(m.item1=mean(s$item1),m.item2=mean(s$item2),m.item3=mean(s$item3),m.item4=mean(s$item4))
|
||||
} else {
|
||||
a <- data.frame(m.item1_1=mean(s$item1_1),m.item1_2=mean(s$item1_2),m.item1_3=mean(s$item1_3),
|
||||
m.item2_1=mean(s$item2_1),m.item2_2=mean(s$item2_2),m.item2_3=mean(s$item2_3),
|
||||
m.item3_1=mean(s$item3_1),m.item3_2=mean(s$item3_2),m.item3_3=mean(s$item3_3),
|
||||
m.item4_1=mean(s$item4_1),m.item4_2=mean(s$item4_2),m.item4_3=mean(s$item4_3)
|
||||
)
|
||||
}
|
||||
} else {
|
||||
if (M==2) {
|
||||
a <- data.frame(m.item1=mean(s$item1),m.item2=mean(s$item2),m.item3=mean(s$item3),m.item4=mean(s$item4),
|
||||
m.item5=mean(s$item5),m.item6=mean(s$item6),m.item7=mean(s$item7))
|
||||
} else {
|
||||
a <- data.frame(m.item1_1=mean(s$item1_1),m.item1_2=mean(s$item1_2),m.item1_3=mean(s$item1_3),
|
||||
m.item2_1=mean(s$item2_1),m.item2_2=mean(s$item2_2),m.item2_3=mean(s$item2_3),
|
||||
m.item3_1=mean(s$item3_1),m.item3_2=mean(s$item3_2),m.item3_3=mean(s$item3_3),
|
||||
m.item4_1=mean(s$item4_1),m.item4_2=mean(s$item4_2),m.item4_3=mean(s$item4_3),
|
||||
m.item5_1=mean(s$item5_1),m.item5_2=mean(s$item5_2),m.item5_3=mean(s$item5_3),
|
||||
m.item6_1=mean(s$item6_1),m.item6_2=mean(s$item6_2),m.item6_3=mean(s$item6_3),
|
||||
m.item7_1=mean(s$item7_1),m.item7_2=mean(s$item7_2),m.item7_3=mean(s$item7_3)
|
||||
)
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
zz <- substr(scenario,start=0,stop=nchar(scenario)-4)
|
||||
N <- substr(scenario,start=nchar(scenario)-2,stop=nchar(scenario))
|
||||
eff.size <- unique(res.dat[res.dat$scenario==zz & res.dat$N==N,'eff.size'])
|
||||
dif.size <- unique(res.dat[res.dat$scenario==zz & res.dat$N==N,'dif.size'])
|
||||
b <- data.frame(scenario=zz,
|
||||
scenario.type=substr(zz,start=nchar(zz),stop=nchar(zz)),
|
||||
N=N,
|
||||
J=J,
|
||||
M=M,
|
||||
eff.size=eff.size,
|
||||
nb.dif=nb.dif,
|
||||
dif.size=dif.size
|
||||
)
|
||||
true.value.in.ci <- eff.size <= s$beta+1.96*s$se_beta & eff.size >= s$beta-1.96*s$se_beta
|
||||
beta.same.sign.truebeta.p <- ifelse(eff.size==0,NA,eff.size/s$beta>0)
|
||||
num.reject <- which((s$beta-1.96*s$se_beta)>0 | (s$beta+1.96*s$se_beta)<0)
|
||||
z <- data.frame(m.beta=mean(s$beta),
|
||||
se.empirical.beta=sd(s$beta),
|
||||
se.analytical.beta=mean(s$se_beta),
|
||||
m.low.ci.beta=mean(s$beta-1.96*s$se_beta),
|
||||
m.high.ci.beta=mean(s$beta+1.96*s$se_beta),
|
||||
@ -510,3 +329,184 @@ points(y=res.null3$h0.rejected.p,x=rep(2,nrow(res.null3)),col='#590b0c',pch=3)
|
||||
res.null5 <- res.null[res.null$dif.size==-0.5,]
|
||||
points(y=res.null5$h0.rejected.p,x=rep(1,nrow(res.null5)),col='#053305',pch=3)
|
||||
par(mfrow=c(1,1))
|
||||
res.dat.dif
|
||||
library(TAM)
|
||||
library(doMC)
|
||||
library(parallel)
|
||||
library(pbmcapply)
|
||||
library(funprog)
|
||||
library(dplyr)
|
||||
lastChar <- function(str){
|
||||
substr(str, nchar(str)-2, nchar(str))
|
||||
}
|
||||
#### Create data.frame
|
||||
results <- c(sapply(1:4,function(x) paste0(x,c('A','B','C','D','E'))),sapply(5:9,function(x) paste0(x,c('A','B','C','D','E','F','G'))))
|
||||
results2 <- c(sapply(10:20,function(x) paste0(x,c('A','B','C','D','E','F','G'))))
|
||||
results <- c(sapply(c(100,200,300),function(x) paste0(results,'_',x)))
|
||||
results2 <- c(sapply(c(100,200,300),function(x) paste0(results2,'_',x)))
|
||||
results <- sort(results)
|
||||
results2 <- sort(results2)
|
||||
results <- c(results,results2)[61:396]
|
||||
#### Compiler function
|
||||
compile_simulation2 <- function(scenario) {
|
||||
name <- as.numeric(gsub("[^0-9.-]", "", substr(scenario,start=0,stop=2)))
|
||||
if (substr(scenario,start=nchar(scenario)-2,stop=nchar(scenario))=="100" & name>4) {
|
||||
s <- read_excel(paste0('/home/corentin/Documents/These/Recherche/Simulations/Analysis/DIF/N100/',scenario,'.xls'))
|
||||
}
|
||||
if (substr(scenario,start=nchar(scenario)-2,stop=nchar(scenario))=="200" & name>4) {
|
||||
s <- read_excel(paste0('/home/corentin/Documents/These/Recherche/Simulations/Analysis/DIF/N200/',scenario,'.xls'))
|
||||
}
|
||||
if (substr(scenario,start=nchar(scenario)-2,stop=nchar(scenario))=="300" & name>4) {
|
||||
s <- read_excel(paste0('/home/corentin/Documents/These/Recherche/Simulations/Analysis/DIF/N300/',scenario,'.xls'))
|
||||
}
|
||||
J <- max(which(sapply(1:7,function(x) paste0('item',x) %in% colnames(s) | paste0('item',x,'_1') %in% colnames(s))))
|
||||
M <- 1+sum(sapply(1:3,function(x) paste0('item1_',x) %in% colnames(s) ))
|
||||
if (M==1) {M <- 2}
|
||||
nb.dif <- max(which(sapply(1:3,function(x) paste0('dif',x) %in% colnames(s) | paste0('dif',x,'_1') %in% colnames(s))))
|
||||
if (J==4) {
|
||||
if (M==2) {
|
||||
a <- data.frame(m.item1=mean(s$item1),m.item2=mean(s$item2),m.item3=mean(s$item3),m.item4=mean(s$item4))
|
||||
} else {
|
||||
a <- data.frame(m.item1_1=mean(s$item1_1),m.item1_2=mean(s$item1_2),m.item1_3=mean(s$item1_3),
|
||||
m.item2_1=mean(s$item2_1),m.item2_2=mean(s$item2_2),m.item2_3=mean(s$item2_3),
|
||||
m.item3_1=mean(s$item3_1),m.item3_2=mean(s$item3_2),m.item3_3=mean(s$item3_3),
|
||||
m.item4_1=mean(s$item4_1),m.item4_2=mean(s$item4_2),m.item4_3=mean(s$item4_3)
|
||||
)
|
||||
}
|
||||
} else {
|
||||
if (M==2) {
|
||||
a <- data.frame(m.item1=mean(s$item1),m.item2=mean(s$item2),m.item3=mean(s$item3),m.item4=mean(s$item4),
|
||||
m.item5=mean(s$item5),m.item6=mean(s$item6),m.item7=mean(s$item7))
|
||||
} else {
|
||||
a <- data.frame(m.item1_1=mean(s$item1_1),m.item1_2=mean(s$item1_2),m.item1_3=mean(s$item1_3),
|
||||
m.item2_1=mean(s$item2_1),m.item2_2=mean(s$item2_2),m.item2_3=mean(s$item2_3),
|
||||
m.item3_1=mean(s$item3_1),m.item3_2=mean(s$item3_2),m.item3_3=mean(s$item3_3),
|
||||
m.item4_1=mean(s$item4_1),m.item4_2=mean(s$item4_2),m.item4_3=mean(s$item4_3),
|
||||
m.item5_1=mean(s$item5_1),m.item5_2=mean(s$item5_2),m.item5_3=mean(s$item5_3),
|
||||
m.item6_1=mean(s$item6_1),m.item6_2=mean(s$item6_2),m.item6_3=mean(s$item6_3),
|
||||
m.item7_1=mean(s$item7_1),m.item7_2=mean(s$item7_2),m.item7_3=mean(s$item7_3)
|
||||
)
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
zz <- substr(scenario,start=0,stop=nchar(scenario)-4)
|
||||
N <- substr(scenario,start=nchar(scenario)-2,stop=nchar(scenario))
|
||||
eff.size <- unique(res.dat[res.dat$scenario==zz & res.dat$N==N,'eff.size'])
|
||||
dif.size <- unique(res.dat[res.dat$scenario==zz & res.dat$N==N,'dif.size'])
|
||||
b <- data.frame(scenario=zz,
|
||||
scenario.type=substr(zz,start=nchar(zz),stop=nchar(zz)),
|
||||
N=N,
|
||||
J=J,
|
||||
M=M,
|
||||
eff.size=eff.size,
|
||||
nb.dif=nb.dif,
|
||||
dif.size=dif.size
|
||||
)
|
||||
true.value.in.ci <- eff.size <= s$beta+1.96*s$se_beta & eff.size >= s$beta-1.96*s$se_beta
|
||||
beta.same.sign.truebeta.p <- ifelse(rep(eff.size,nrow(s))==0,NA,(rep(eff.size,nrow(s))/s$beta)>0)
|
||||
num.reject <- which((s$beta-1.96*s$se_beta)>0 | (s$beta+1.96*s$se_beta)<0)
|
||||
z <- data.frame(m.beta=mean(s$beta),
|
||||
se.empirical.beta=sd(s$beta),
|
||||
se.analytical.beta=mean(s$se_beta),
|
||||
m.low.ci.beta=mean(s$beta-1.96*s$se_beta),
|
||||
m.high.ci.beta=mean(s$beta+1.96*s$se_beta),
|
||||
true.value.in.ci.p=mean(true.value.in.ci),
|
||||
h0.rejected.p=mean( (s$beta-1.96*s$se_beta)>0 | (s$beta+1.96*s$se_beta)<0 ),
|
||||
beta.same.sign.truebeta.p=mean(beta.same.sign.truebeta.p),
|
||||
beta.same.sign.truebeta.signif.p=mean(beta.same.sign.truebeta.p[num.reject])
|
||||
)
|
||||
d <- cbind(b,a,z)
|
||||
d$prop.
|
||||
return(d)
|
||||
}
|
||||
#### Compiled results
|
||||
res.dat.dif <- compile_simulation2('5A_100')
|
||||
library(readxl)
|
||||
#### Create data.frame
|
||||
results <- c(sapply(1:4,function(x) paste0(x,c('A','B','C','D','E'))),sapply(5:9,function(x) paste0(x,c('A','B','C','D','E','F','G'))))
|
||||
results2 <- c(sapply(10:20,function(x) paste0(x,c('A','B','C','D','E','F','G'))))
|
||||
results <- c(sapply(c(100,200,300),function(x) paste0(results,'_',x)))
|
||||
results2 <- c(sapply(c(100,200,300),function(x) paste0(results2,'_',x)))
|
||||
results <- sort(results)
|
||||
results2 <- sort(results2)
|
||||
results <- c(results,results2)[61:396]
|
||||
#### Compiler function
|
||||
compile_simulation2 <- function(scenario) {
|
||||
name <- as.numeric(gsub("[^0-9.-]", "", substr(scenario,start=0,stop=2)))
|
||||
if (substr(scenario,start=nchar(scenario)-2,stop=nchar(scenario))=="100" & name>4) {
|
||||
s <- read_excel(paste0('/home/corentin/Documents/These/Recherche/Simulations/Analysis/DIF/N100/',scenario,'.xls'))
|
||||
}
|
||||
if (substr(scenario,start=nchar(scenario)-2,stop=nchar(scenario))=="200" & name>4) {
|
||||
s <- read_excel(paste0('/home/corentin/Documents/These/Recherche/Simulations/Analysis/DIF/N200/',scenario,'.xls'))
|
||||
}
|
||||
if (substr(scenario,start=nchar(scenario)-2,stop=nchar(scenario))=="300" & name>4) {
|
||||
s <- read_excel(paste0('/home/corentin/Documents/These/Recherche/Simulations/Analysis/DIF/N300/',scenario,'.xls'))
|
||||
}
|
||||
J <- max(which(sapply(1:7,function(x) paste0('item',x) %in% colnames(s) | paste0('item',x,'_1') %in% colnames(s))))
|
||||
M <- 1+sum(sapply(1:3,function(x) paste0('item1_',x) %in% colnames(s) ))
|
||||
if (M==1) {M <- 2}
|
||||
nb.dif <- max(which(sapply(1:3,function(x) paste0('dif',x) %in% colnames(s) | paste0('dif',x,'_1') %in% colnames(s))))
|
||||
if (J==4) {
|
||||
if (M==2) {
|
||||
a <- data.frame(m.item1=mean(s$item1),m.item2=mean(s$item2),m.item3=mean(s$item3),m.item4=mean(s$item4))
|
||||
} else {
|
||||
a <- data.frame(m.item1_1=mean(s$item1_1),m.item1_2=mean(s$item1_2),m.item1_3=mean(s$item1_3),
|
||||
m.item2_1=mean(s$item2_1),m.item2_2=mean(s$item2_2),m.item2_3=mean(s$item2_3),
|
||||
m.item3_1=mean(s$item3_1),m.item3_2=mean(s$item3_2),m.item3_3=mean(s$item3_3),
|
||||
m.item4_1=mean(s$item4_1),m.item4_2=mean(s$item4_2),m.item4_3=mean(s$item4_3)
|
||||
)
|
||||
}
|
||||
} else {
|
||||
if (M==2) {
|
||||
a <- data.frame(m.item1=mean(s$item1),m.item2=mean(s$item2),m.item3=mean(s$item3),m.item4=mean(s$item4),
|
||||
m.item5=mean(s$item5),m.item6=mean(s$item6),m.item7=mean(s$item7))
|
||||
} else {
|
||||
a <- data.frame(m.item1_1=mean(s$item1_1),m.item1_2=mean(s$item1_2),m.item1_3=mean(s$item1_3),
|
||||
m.item2_1=mean(s$item2_1),m.item2_2=mean(s$item2_2),m.item2_3=mean(s$item2_3),
|
||||
m.item3_1=mean(s$item3_1),m.item3_2=mean(s$item3_2),m.item3_3=mean(s$item3_3),
|
||||
m.item4_1=mean(s$item4_1),m.item4_2=mean(s$item4_2),m.item4_3=mean(s$item4_3),
|
||||
m.item5_1=mean(s$item5_1),m.item5_2=mean(s$item5_2),m.item5_3=mean(s$item5_3),
|
||||
m.item6_1=mean(s$item6_1),m.item6_2=mean(s$item6_2),m.item6_3=mean(s$item6_3),
|
||||
m.item7_1=mean(s$item7_1),m.item7_2=mean(s$item7_2),m.item7_3=mean(s$item7_3)
|
||||
)
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
zz <- substr(scenario,start=0,stop=nchar(scenario)-4)
|
||||
N <- substr(scenario,start=nchar(scenario)-2,stop=nchar(scenario))
|
||||
eff.size <- unique(res.dat[res.dat$scenario==zz & res.dat$N==N,'eff.size'])
|
||||
dif.size <- unique(res.dat[res.dat$scenario==zz & res.dat$N==N,'dif.size'])
|
||||
b <- data.frame(scenario=zz,
|
||||
scenario.type=substr(zz,start=nchar(zz),stop=nchar(zz)),
|
||||
N=N,
|
||||
J=J,
|
||||
M=M,
|
||||
eff.size=eff.size,
|
||||
nb.dif=nb.dif,
|
||||
dif.size=dif.size
|
||||
)
|
||||
true.value.in.ci <- eff.size <= s$beta+1.96*s$se_beta & eff.size >= s$beta-1.96*s$se_beta
|
||||
beta.same.sign.truebeta.p <- ifelse(rep(eff.size,nrow(s))==0,NA,(rep(eff.size,nrow(s))/s$beta)>0)
|
||||
num.reject <- which((s$beta-1.96*s$se_beta)>0 | (s$beta+1.96*s$se_beta)<0)
|
||||
z <- data.frame(m.beta=mean(s$beta),
|
||||
se.empirical.beta=sd(s$beta),
|
||||
se.analytical.beta=mean(s$se_beta),
|
||||
m.low.ci.beta=mean(s$beta-1.96*s$se_beta),
|
||||
m.high.ci.beta=mean(s$beta+1.96*s$se_beta),
|
||||
true.value.in.ci.p=mean(true.value.in.ci),
|
||||
h0.rejected.p=mean( (s$beta-1.96*s$se_beta)>0 | (s$beta+1.96*s$se_beta)<0 ),
|
||||
beta.same.sign.truebeta.p=mean(beta.same.sign.truebeta.p),
|
||||
beta.same.sign.truebeta.signif.p=mean(beta.same.sign.truebeta.p[num.reject])
|
||||
)
|
||||
d <- cbind(b,a,z)
|
||||
d$prop.
|
||||
return(d)
|
||||
}
|
||||
#### Compiled results
|
||||
res.dat.dif <- compile_simulation2('5A_100')
|
||||
for (x in results[seq(2,length(results))]) {
|
||||
y <- compile_simulation2(x)
|
||||
res.dat.dif <- bind_rows(res.dat.dif,y)
|
||||
}
|
||||
res.dat.dif
|
||||
paste(c(1,5,7,9,11),'A')
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(1,5,7,9,11),'A') & res.dat$N==100,]$true.power
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(1,5,7,9,11),'A') & res.dat$N==100,]
|
||||
|
||||
@ -10,6 +10,7 @@ library(parallel)
|
||||
library(pbmcapply)
|
||||
library(funprog)
|
||||
library(dplyr)
|
||||
library(readxl)
|
||||
|
||||
lastChar <- function(str){
|
||||
substr(str, nchar(str)-2, nchar(str))
|
||||
@ -2264,3 +2265,192 @@ for (x in results[seq(2,length(results))]) {
|
||||
y <- compile_simulation2(x)
|
||||
res.dat.dif <- bind_rows(res.dat.dif,y)
|
||||
}
|
||||
|
||||
|
||||
##############################################################################
|
||||
#----------------------------------------------------------------------------#
|
||||
################################## RASCHPOWER ################################
|
||||
#----------------------------------------------------------------------------#
|
||||
##############################################################################
|
||||
|
||||
###### Puissance théorique
|
||||
|
||||
res.dat$theoretical.power <- 0
|
||||
|
||||
### Scénarios N=100
|
||||
|
||||
## Scénarios J=4 / M=2
|
||||
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(1,5,7,9,11),'A') & res.dat$N==100,]$theoretical.power <- 0.0250
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(1,5,7,9,11),'B') & res.dat$N==100,]$theoretical.power <- 0.1524
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(5,7,9,11),'C') & res.dat$N==100,]$theoretical.power <- 0.1524
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(5,7,9,11),'D') & res.dat$N==100,]$theoretical.power <- 0.4626
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(5,7,9,11),'E') & res.dat$N==100,]$theoretical.power <- 0.4626
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(5,7,9,11),'F') & res.dat$N==100,]$theoretical.power <- 0.1524
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(5,7,9,11),'G') & res.dat$N==100,]$theoretical.power <- 0.4626
|
||||
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(1,'C') & res.dat$N==100,]$theoretical.power <- 0.4626
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(1,'D') & res.dat$N==100,]$theoretical.power <- 0.1524
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(1,'E') & res.dat$N==100,]$theoretical.power <- 0.4626
|
||||
|
||||
## Scénarios J=4 / M=4
|
||||
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(2,6,8,10,12),'A') & res.dat$N==100,]$theoretical.power <- 0.0250
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(2,6,8,10,12),'B') & res.dat$N==100,]$theoretical.power <- 0.1522
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(6,8,10,12),'C') & res.dat$N==100,]$theoretical.power <- 0.1522
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(6,8,10,12),'D') & res.dat$N==100,]$theoretical.power <- 0.4626
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(6,8,10,12),'E') & res.dat$N==100,]$theoretical.power <- 0.4626
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(6,8,10,12),'F') & res.dat$N==100,]$theoretical.power <- 0.1522
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(6,8,10,12),'G') & res.dat$N==100,]$theoretical.power <- 0.4626
|
||||
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(2,'C') & res.dat$N==100,]$theoretical.power <- 0.4626
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(2,'D') & res.dat$N==100,]$theoretical.power <- 0.1522
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(2,'E') & res.dat$N==100,]$theoretical.power <- 0.4626
|
||||
|
||||
## Scénarios J=7 / M=2
|
||||
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(3,13,15,17,19),'A') & res.dat$N==100,]$theoretical.power <- 0.0250
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(3,13,15,17,19),'B') & res.dat$N==100,]$theoretical.power <- 0.1857
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(13,15,17,19),'C') & res.dat$N==100,]$theoretical.power <- 0.1857
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(13,15,17,19),'D') & res.dat$N==100,]$theoretical.power <- 0.5669
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(13,15,17,19),'E') & res.dat$N==100,]$theoretical.power <- 0.5669
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(13,15,17,19),'F') & res.dat$N==100,]$theoretical.power <- 0.1857
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(13,15,17,19),'G') & res.dat$N==100,]$theoretical.power <- 0.5669
|
||||
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(3,'C') & res.dat$N==100,]$theoretical.power <- 0.5669
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(3,'D') & res.dat$N==100,]$theoretical.power <- 0.1857
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(3,'E') & res.dat$N==100,]$theoretical.power <- 0.5669
|
||||
|
||||
## Scénarios J=7 / M=4
|
||||
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(4,14,16,18,20),'A') & res.dat$N==100,]$theoretical.power <- 0.0250
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(4,14,16,18,20),'B') & res.dat$N==100,]$theoretical.power <- 0.1852
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(14,16,18,20),'C') & res.dat$N==100,]$theoretical.power <- 0.1852
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(14,16,18,20),'D') & res.dat$N==100,]$theoretical.power <- 0.5669
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(14,16,18,20),'E') & res.dat$N==100,]$theoretical.power <- 0.5669
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(14,16,18,20),'F') & res.dat$N==100,]$theoretical.power <- 0.1852
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(14,16,18,20),'G') & res.dat$N==100,]$theoretical.power <- 0.5669
|
||||
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(4,'C') & res.dat$N==100,]$theoretical.power <- 0.5669
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(4,'D') & res.dat$N==100,]$theoretical.power <- 0.1852
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(4,'E') & res.dat$N==100,]$theoretical.power <- 0.5669
|
||||
|
||||
|
||||
### Scénarios N=200
|
||||
|
||||
## Scénarios J=4 / M=2
|
||||
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(1,5,7,9,11),'A') & res.dat$N==200,]$theoretical.power <- 0.0250
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(1,5,7,9,11),'B') & res.dat$N==200,]$theoretical.power <- 0.2613
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(5,7,9,11),'C') & res.dat$N==200,]$theoretical.power <- 0.2613
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(5,7,9,11),'D') & res.dat$N==200,]$theoretical.power <- 0.7507
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(5,7,9,11),'E') & res.dat$N==200,]$theoretical.power <- 0.7507
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(5,7,9,11),'F') & res.dat$N==200,]$theoretical.power <- 0.2613
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(5,7,9,11),'G') & res.dat$N==200,]$theoretical.power <- 0.7507
|
||||
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(1,'C') & res.dat$N==200,]$theoretical.power <- 0.7507
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(1,'D') & res.dat$N==200,]$theoretical.power <- 0.2613
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(1,'E') & res.dat$N==200,]$theoretical.power <- 0.7507
|
||||
|
||||
## Scénarios J=4 / M=4
|
||||
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(2,6,8,10,12),'A') & res.dat$N==200,]$theoretical.power <- 0.0250
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(2,6,8,10,12),'B') & res.dat$N==200,]$theoretical.power <- 0.2606
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(6,8,10,12),'C') & res.dat$N==200,]$theoretical.power <- 0.2606
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(6,8,10,12),'D') & res.dat$N==200,]$theoretical.power <- 0.7507
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(6,8,10,12),'E') & res.dat$N==200,]$theoretical.power <- 0.7507
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(6,8,10,12),'F') & res.dat$N==200,]$theoretical.power <- 0.2606
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(6,8,10,12),'G') & res.dat$N==200,]$theoretical.power <- 0.4626
|
||||
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(2,'C') & res.dat$N==200,]$theoretical.power <- 0.7507
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(2,'D') & res.dat$N==200,]$theoretical.power <- 0.2606
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(2,'E') & res.dat$N==200,]$theoretical.power <- 0.7507
|
||||
|
||||
## Scénarios J=7 / M=2
|
||||
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(3,13,15,17,19),'A') & res.dat$N==200,]$theoretical.power <- 0.0250
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(3,13,15,17,19),'B') & res.dat$N==200,]$theoretical.power <- 0.3256
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(13,15,17,19),'C') & res.dat$N==200,]$theoretical.power <- 0.3256
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(13,15,17,19),'D') & res.dat$N==200,]$theoretical.power <- 0.8538
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(13,15,17,19),'E') & res.dat$N==200,]$theoretical.power <- 0.8538
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(13,15,17,19),'F') & res.dat$N==200,]$theoretical.power <- 0.3256
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(13,15,17,19),'G') & res.dat$N==200,]$theoretical.power <- 0.8538
|
||||
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(3,'C') & res.dat$N==200,]$theoretical.power <- 0.8538
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(3,'D') & res.dat$N==200,]$theoretical.power <- 0.3256
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(3,'E') & res.dat$N==200,]$theoretical.power <- 0.8538
|
||||
|
||||
## Scénarios J=7 / M=4
|
||||
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(4,14,16,18,20),'A') & res.dat$N==200,]$theoretical.power <- 0.0250
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(4,14,16,18,20),'B') & res.dat$N==200,]$theoretical.power <- 0.3251
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(14,16,18,20),'C') & res.dat$N==200,]$theoretical.power <- 0.3251
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(14,16,18,20),'D') & res.dat$N==200,]$theoretical.power <- 0.8538
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(14,16,18,20),'E') & res.dat$N==200,]$theoretical.power <- 0.8538
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(14,16,18,20),'F') & res.dat$N==200,]$theoretical.power <- 0.3251
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(14,16,18,20),'G') & res.dat$N==200,]$theoretical.power <- 0.8538
|
||||
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(4,'C') & res.dat$N==200,]$theoretical.power <- 0.8538
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(4,'D') & res.dat$N==200,]$theoretical.power <- 0.3251
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(4,'E') & res.dat$N==200,]$theoretical.power <- 0.8538
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
|
||||
### Scénarios N=300
|
||||
|
||||
## Scénarios J=4 / M=2
|
||||
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(1,5,7,9,11),'A') & res.dat$N==300,]$theoretical.power <- 0.0250
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(1,5,7,9,11),'B') & res.dat$N==300,]$theoretical.power <- 0.1524
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(5,7,9,11),'C') & res.dat$N==300,]$theoretical.power <- 0.1524
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(5,7,9,11),'D') & res.dat$N==300,]$theoretical.power <- 0.4626
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(5,7,9,11),'E') & res.dat$N==300,]$theoretical.power <- 0.4626
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(5,7,9,11),'F') & res.dat$N==300,]$theoretical.power <- 0.1524
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(5,7,9,11),'G') & res.dat$N==300,]$theoretical.power <- 0.4626
|
||||
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(1,'C') & res.dat$N==300,]$theoretical.power <- 0.4626
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(1,'D') & res.dat$N==300,]$theoretical.power <- 0.1524
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(1,'E') & res.dat$N==300,]$theoretical.power <- 0.4626
|
||||
|
||||
## Scénarios J=4 / M=4
|
||||
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(2,6,8,10,12),'A') & res.dat$N==300,]$theoretical.power <- 0.0250
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(2,6,8,10,12),'B') & res.dat$N==300,]$theoretical.power <- 0.1522
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(6,8,10,12),'C') & res.dat$N==300,]$theoretical.power <- 0.1522
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(6,8,10,12),'D') & res.dat$N==300,]$theoretical.power <- 0.4626
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(6,8,10,12),'E') & res.dat$N==300,]$theoretical.power <- 0.4626
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(6,8,10,12),'F') & res.dat$N==300,]$theoretical.power <- 0.1522
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(6,8,10,12),'G') & res.dat$N==300,]$theoretical.power <- 0.4626
|
||||
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(2,'C') & res.dat$N==300,]$theoretical.power <- 0.4626
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(2,'D') & res.dat$N==300,]$theoretical.power <- 0.1522
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(2,'E') & res.dat$N==300,]$theoretical.power <- 0.4626
|
||||
|
||||
## Scénarios J=7 / M=2
|
||||
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(3,13,15,17,19),'A') & res.dat$N==300,]$theoretical.power <- 0.0250
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(3,13,15,17,19),'B') & res.dat$N==300,]$theoretical.power <- 0.1857
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(13,15,17,19),'C') & res.dat$N==300,]$theoretical.power <- 0.1857
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(13,15,17,19),'D') & res.dat$N==300,]$theoretical.power <- 0.5669
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(13,15,17,19),'E') & res.dat$N==300,]$theoretical.power <- 0.5669
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(13,15,17,19),'F') & res.dat$N==300,]$theoretical.power <- 0.1857
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(13,15,17,19),'G') & res.dat$N==300,]$theoretical.power <- 0.5669
|
||||
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(3,'C') & res.dat$N==300,]$theoretical.power <- 0.5669
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(3,'D') & res.dat$N==300,]$theoretical.power <- 0.1857
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(3,'E') & res.dat$N==300,]$theoretical.power <- 0.5669
|
||||
|
||||
## Scénarios J=7 / M=4
|
||||
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(4,14,16,18,20),'A') & res.dat$N==300,]$theoretical.power <- 0.0250
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(4,14,16,18,20),'B') & res.dat$N==300,]$theoretical.power <- 0.1852
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(14,16,18,20),'C') & res.dat$N==300,]$theoretical.power <- 0.1852
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(14,16,18,20),'D') & res.dat$N==300,]$theoretical.power <- 0.5669
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(14,16,18,20),'E') & res.dat$N==300,]$theoretical.power <- 0.5669
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(14,16,18,20),'F') & res.dat$N==300,]$theoretical.power <- 0.1852
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(c(14,16,18,20),'G') & res.dat$N==300,]$theoretical.power <- 0.5669
|
||||
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(4,'C') & res.dat$N==300,]$theoretical.power <- 0.5669
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(4,'D') & res.dat$N==300,]$theoretical.power <- 0.1852
|
||||
res.dat[res.dat$scenario %in% paste0(4,'E') & res.dat$N==300,]$theoretical.power <- 0.5669
|
||||
Reference in New Issue
Block a user